Le Village de Brainans est construit au pied d'un mont préservé sur une altitude d'environ 300 m avec l'église qui surplombe le sommet de la colline. Ce lieu est également une aire de repos pour les randonneurs, un magnifique panorama à 360° s'offre au regard des amoureux de la nature.

 

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Trois rues principales s'articulent autour de ce relief paisible avec de nombreuses ballades dans une nature protégée, ceci est assez rare même dans les campagnes jurassiennes pourtant faiblement développées.

 

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Paradoxalement, le village est bien situé, à 5 minutes de l'autoroute A39, à 8 minutes de Poligny, à 25 minutes de Lons ou de Dole, à 45 minutes de Dijon ou de Besançon. La suisse est à 1h00 et Genève à 1h30, Paris par l'autoroute est à 3h30. Pour les amateurs de ski, les pistes du Haut-Jura sont à 50 minutes. Et Brainans est à la lisière de la plaine Jurassienne et Bressane (lacs, forêts…).

La commune est traversée d'est en ouest par la rivière l'Orain très appréciée par les pêcheurs. Le village de Brainans s'est formé à l'est de la voie romaine qui reliait historiquement Paris à Genève. Plusieurs lieux-dits du territoire rappellent par leurs noms le souvenir de l'époque gallo-romaine.